産品簡介
基因組從頭組裝(denovo)是(shì)指在(zài)不(bù)依賴參考基因組的(de)情況下對真/細菌進行基因組測序及拼接組裝,從而(ér)繪制該物種的(de)全基因組序列圖譜。真菌及細菌基因組一(yī / yì /yí)般較小,真菌在(zài)100M内,采用三代測序技術可組裝出(chū)較高質量基因組。
研究内容
1) 數據質控
2) 基因組組裝;
3) 基因組情況評估
4) 基因組組分分析:
編碼基因預測;重複序列注釋;非編碼RNA預測;假基因分析
6) 基因功能注釋:
通用數據庫注釋:GO, KEGG, COG, Swiss-prot, Nr, KOG, pfam;
7) 分泌蛋白分析;各專用數據庫注釋
8) 比較基因組學分析
結果展示
送樣建議
1、真菌需純培養以(yǐ)避免雜菌污染,菌絲量200mg以(yǐ)上(shàng);
2、DNA要(yào / yāo)求:總量≥10ug,濃度≥50ng/µl,OD260/280:1.8-2.0,電泳要(yào / yāo)求:主帶清晰,無降解或輕度降解;
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