産品簡介
轉錄組測序(Transcriptome Sequencing)是(shì)對某一(yī / yì /yí)物種特定時(shí)間點或特定條件下的(de)mRNA進行高通量測序。轉錄組測序能夠動态反映基因的(de)轉錄水平,同時(shí)可鑒定和(hé / huò)定量稀有轉錄本和(hé / huò)正常轉錄本,并且提供樣品特異的(de)轉錄本序列結構信息。
研究内容
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有參考基因組 |
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無參考基因組 |
1) 與參考基因組比對; 2) 基因結構優化; 3) 新轉錄本預測; 4) 可變剪接分析; 5) SNP、Indel分析; 6) 轉錄組因子(zǐ)分析; |
1) 轉錄組本拼接; 2) Unigene功能注釋; 3) CDS預測; 4) SNP分析; 5) SSR分析; 6) 轉錄組因子(zǐ)分析; |
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7) 樣品相關性分析; 8) 基因表達水平分析; 9) 基因表達差異分析; 10) 差異基因功能富集分析; 11) 蛋白互作網絡分析; 12) 分析結果可視化。 |
7) 樣品間相關性分析; 8) 基因表達水平分析; 9) 基因表達差異分析; 10) 差異基因功能富集分析; 11) 蛋白互作網絡分析; 12) 分析結果可視化。 |
結果展示
送樣建議
1) 樣品類型:總RNA;
2) 樣品濃度:≥50ng/µg;
3) RNA總量:≥1µg;
4) RNA純度:OD260/280:1.8-2.0;OD260/230≥1.8,260處有正常峰值;
5) RNA完整度:電泳檢測28s/18s≥1.5或RIN≥6.8(動物)、6.3(植物、真菌),基線平整(軟體等無28S物種)。
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