産品簡介

宏基因組是(shì)指特定環境中全部微生物遺傳物質的(de)總和(hé / huò)，宏基因組測序以(yǐ)特定環境中全部微生物群落作爲(wéi / wèi)研究的(de)對象，提取環境微生物總DNA進行測序及分析；宏基因組擺脫了(le／liǎo)傳統微生物研究中分離培養的(de)技術限制，在(zài)基因組水平解讀微生物群體的(de)多樣性和(hé / huò)豐度，探索微生物與環境及宿主之(zhī)間的(de)關系。
研究内容

1) 數據質控
2) 基因組組裝及基因預測
3) 物種注釋
   各分類水平上(shàng)物種豐度圖；Alpha多樣性分析；樣品間差異組成PCA分析；
4) 基因組分預測
   基因預測；轉座元件預測；前噬菌體預測
5) 基因功能注釋
   基因家族分類；通用數據庫注釋：GO, KEGG, COG, Swiss-prot, Nr, KOG, pfam；專用數據庫注釋；
6) 多樣品比較分析
   篩選與樣品分組顯著相關因子(zǐ)（基因、功能）；基于(yú)篩選因子(zǐ)對樣品進行主成分分析（PCA）；基于(yú)篩選因子(zǐ)對樣品進行  聚類分析。
結果展示

送樣建議

1、一(yī / yì ／yí)般以(yǐ)土壤、水體、腸道(dào)、根際等微生物爲(wéi / wèi)研究對象；
2、樣品選取需要(yào / yāo)以(yǐ)時(shí)間、地(dì / de)域、深度、部位等爲(wéi / wèi)參考，建議每個(gè)樣品設置3個(gè)以(yǐ)上(shàng)生物學重複；
3、DNA要(yào / yāo)求：總量≥150ng，濃度≥50ng/µl，OD260/280：1.8-2.0，電泳要(yào / yāo)求：主帶清晰，無降解或輕度降解；
4、組織樣要(yào / yāo)求：土壤、根系等固體樣本約1-3g；菌液樣本需離心取沉澱物，不(bù)少于(yú)50mg；