産品簡介
原核轉錄組測序分析是(shì)針對原核微生物設計開展的(de)轉錄組學測序分析研究。微生物在(zài)特定生境或時(shí)期中會表現出(chū)基因表達差異性,以(yǐ)此應對環境變化。由于(yú)原核生物mRNA沒有polyA尾結構,所以(yǐ)需要(yào / yāo)去除核糖體RNA、構建鏈特異性文庫等實驗步驟,最終獲得特定時(shí)期或者環境下微生物體内所有轉錄本(包括mRNA,非編碼RNA等)的(de)表達量差異信息及功能特征,從而(ér)找出(chū)關鍵的(de)差異功能基因。
研究内容
1) 測序質量值分布統計;
2) 測序堿基質量控制;
3) 測序數據産出(chū)統計;
4) 與參考基因組比對分析;
5) 基因表達定量;
6) RNA-Seq整體質量評估:Insert長度檢驗;測序随機性分析;測序飽和(hé / huò)度分析;
7) SNP分析;
8) 新轉錄本預測;
9) 基因結構優化分析;
10) UTR分析;
11) 反義轉錄本預測;
12) 重複相關性檢測(有生物學重複);
13) 不(bù)同樣品表達量對比(兩個(gè)或以(yǐ)上(shàng)樣品);
14) 差異表達基因篩選(兩個(gè)或以(yǐ)上(shàng)樣品);
15) 差異表達基因聚類分析(兩個(gè)或以(yǐ)上(shàng)樣品);
16) 差異表達基因的(de)功能注釋及富集分析(兩個(gè)或以(yǐ)上(shàng)樣品): 差異表達基因GO功能富集;差異表達基因COG分類;差異表達基因KEGG注釋;差異表達基因KEGG通路富集分析;
17) sRNA分析。
結果展示
送樣建議
1) 樣品類型:總RNA;
2) 樣品濃度:≥50ng/µg;
3) RNA總量:≥2µg;
4) RNA純度:OD260/280:1.8-2.0;OD260/230≥1.8,260處有正常峰值;
5) RNA完整度:RIN≥6.8。