科技服務

SCIENCE AND TECHNOLOGY SERVICE

small RNA測序

産品簡介

Small RNA是(shì)一(yī / yì /yí)類長度在(zài)18-30nt範圍的(de)調控因子(zǐ),在(zài)基因表達調控、生物個(gè)體發育、代謝及疾病的(de)發生等生理過程中起着重要(yào / yāo)的(de)作用。

研究内容

1) 測序質量值分布統計;

2) 測序堿基質量控制;

3) 測序數據産出(chū)統計;

4) 樣品間公共及特有序列分析(兩個(gè)或兩個(gè)樣品以(yǐ)上(shàng));

5) 與參考序列進行比對;

6) 與相關生物數據庫(miRBASE、RepBASE、Rfam、SILVA、ncRNAs等)及參考基因組比對,分類注釋Small RNA;

7) miRNA鑒定:已知miRNA鑒定;

8) miRNA長度分布分析;

9) miRNA基因組分布分析(針對有ref物種);

10) 預測新miRNA及二級結構模式圖繪制;

11) miRNA堿基偏好性分析;

12) miRNA堿基編輯分析;

13) miRNA家族分析;

14) miRNA定量分析;

15) miRNA差異表達分析:重複相關性檢測;差異表達篩選;差異表達miRNA統計;

16) 差異表達miRNA篩選;

17) 差異表達miRNA聚類分析;

18) miRNA靶基因預測;

19) 差異表達miRNA靶基因注釋;

20) 差異表達miRNA靶基因的(de)GO分類;

21) 差異miRNA靶基因GO富集層次分析;

22) 差異miRNA靶基因的(de)COG注釋;

23) 差異miRNA靶基因KEGG注釋;

24) 差異miRNA靶基因KEGG通路富集分析。

結果展示

送樣建議

1) 樣品類型:總RNA;
2) 樣品濃度:≥50ng/µg;
3) RNA總量:≥3µg;
4) RNA純度:OD260/280:1.8-2.0;OD260/230≥1.8,260處有正常峰值;
5) RNA完整度:電泳檢測28s/18s≥1.5或RIN≥7.5(動物)、7(植物、真菌),基線平整(軟體等無28S物種)。


010-80543251

掃一(yī / yì /yí)掃
關注公衆号

掃一(yī / yì /yí)掃關注公衆号