産品簡介
Small RNA是(shì)一(yī / yì /yí)類長度在(zài)18-30nt範圍的(de)調控因子(zǐ),在(zài)基因表達調控、生物個(gè)體發育、代謝及疾病的(de)發生等生理過程中起着重要(yào / yāo)的(de)作用。
研究内容
1) 測序質量值分布統計;
2) 測序堿基質量控制;
3) 測序數據産出(chū)統計;
4) 樣品間公共及特有序列分析(兩個(gè)或兩個(gè)樣品以(yǐ)上(shàng));
5) 與參考序列進行比對;
6) 與相關生物數據庫(miRBASE、RepBASE、Rfam、SILVA、ncRNAs等)及參考基因組比對,分類注釋Small RNA;
7) miRNA鑒定:已知miRNA鑒定;
8) miRNA長度分布分析;
9) miRNA基因組分布分析(針對有ref物種);
10) 預測新miRNA及二級結構模式圖繪制;
11) miRNA堿基偏好性分析;
12) miRNA堿基編輯分析;
13) miRNA家族分析;
14) miRNA定量分析;
15) miRNA差異表達分析:重複相關性檢測;差異表達篩選;差異表達miRNA統計;
16) 差異表達miRNA篩選;
17) 差異表達miRNA聚類分析;
18) miRNA靶基因預測;
19) 差異表達miRNA靶基因注釋;
20) 差異表達miRNA靶基因的(de)GO分類;
21) 差異miRNA靶基因GO富集層次分析;
22) 差異miRNA靶基因的(de)COG注釋;
23) 差異miRNA靶基因KEGG注釋;
結果展示
送樣建議
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