産品簡介
近年來(lái)，高通量測序技術的(de)迅猛發展，極大(dà)地(dì / de)推動了(le／liǎo)全基因組測序工作的(de)展開，全球已有幾百種的(de)植物和(hé / huò)動物完成了(le／liǎo)全基因組測序工作。通過全基因組測序，人(rén)們可以(yǐ)獲得物種的(de)全基因組序列圖譜，從而(ér)爲(wéi / wèi)該物種後續的(de)研究和(hé / huò)産業化應用奠定基礎。随着高通量測序技術的(de)發展，成本的(de)降低，動植物基因組組裝不(bù)再 是(shì)大(dà)牛的(de)專利，假如您緻力于(yú)該物種的(de)深入研究，denovo測序組裝它的(de)基因組必然會推動您的(de)研究進程。
基因組從頭測序（De novo sequencing）是(shì)在(zài)不(bù)依賴參考基因組的(de)情況下對某物種進行基因組測序及拼接組裝，從而(ér)繪制該物種的(de)全基因組序列圖譜。基因組測序不(bù)僅可以(yǐ)獲得該物種的(de)全基因組序列圖譜，同時(shí)也(yě)爲(wéi / wèi)後續物種起源進化及特定環境适應性的(de)研究奠定了(le／liǎo)基礎。
研究内容
基因組Survey：
1) K-mer分析以(yǐ)及基因組大(dà)小估算；2) 雜合率估算；3) 初步組裝；4) GC含量評估。
基因組組裝：
1) 組裝結果評估；2) GC-Depth分布分析；3) GC含量分布分析；4) 測序深度分析；5) 常染色體區域覆蓋度評估（需要(yào / yāo)客戶提供BAC或者Fosmid序列）；6) 基因區覆蓋度評估（需要(yào / yāo)客戶提供EST或者轉錄組序列）。
基因組注釋：
1) repeat注釋；2) 基因預測；3) 基因功能注釋；4) ncRNA注釋。
比較基因組學分析：
1) 基因聚類分析（也(yě)叫基因家族鑒定，動物TreeFam；植物OrthoMCL）；2) 物種系統進化分析；3) 物種分歧時(shí)間估算（需要(yào / yāo)标定時(shí)間信息）；4) 基因組共線性分析；5) 全基因組複制分析（動物WGAC；植物WGD）。
定制化個(gè)性化分析：
結合客戶需求，協商确定個(gè)性化分析内容。
結果展示
送樣建議
1) 樣品類型：DNA；
2) 樣品濃度：≥50 ng/ul（Qubit定量）；
3) 樣品總量：>60ug（Qubit定量）；
4) 樣品純度：OD260/280：1.7 ~ 2.2；OD260/230≥0.5；260吸收峰正常不(bù)偏移；無蛋白質、RNA或肉眼可見雜質污染；
5) 若提供組織樣品，則植物樣本需爲(wéi / wèi)無菌黃化苗、組培樣品或嫩葉；
6）若需要(yào / yāo)做Hi-C測序，則需要(yào / yāo)提供新鮮的(de)活體。
注：需從同一(yī / yì ／yí)個(gè)體取樣，預防由于(yú)個(gè)體差異對後續拼接造成的(de)影響，調研圖和(hé / huò)精細圖也(yě)需要(yào / yāo)從同一(yī / yì ／yí)個(gè)體取樣；如無選取同一(yī / yì ／yí)個(gè)體的(de)條件，須再溝通決定取樣方式。
