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SCIENCE AND TECHNOLOGY SERVICE

環狀RNA測序

産品簡介

環狀RNA(circular RNA)是(shì)5’端和(hé / huò)3’端共價結構閉合環狀的(de)非編碼RNA,是(shì)廣泛存在(zài)于(yú)動植物中的(de)一(yī / yì /yí)種特殊的(de)lncRNA,具有很高的(de)保守性和(hé / huò)組織特異性,獨特的(de)環狀結構使其不(bù)易被RNase降解,在(zài)胞内具有較強的(de)穩定性。按其來(lái)源可分爲(wéi / wèi)内含子(zǐ)CircRNA和(hé / huò)外顯子(zǐ)CircRNA兩類,主要(yào / yāo)通過(1)作用于(yú)轉錄組因子(zǐ),(2)競争性結合miRNA,(3)結合核糖體誘導開環再重新表達等三種方式實現其調控基因表達的(de)功能。CircRNA一(yī / yì /yí)經發現就(jiù)因其獨特的(de)存在(zài)形式引起科學家的(de)廣泛興趣,随着近幾年測序技術的(de)發展,CircRNA檢測技術亦日漸成熟。

研究内容

1) 測序質量值分布統計;

2) 測序堿基質量控制;

3) 測序數據産出(chū)統計;

4) 測序文庫質量評估;

5) 與參考序列進行比對(比對效率統計;比對結果作圖);

6) CIRI識别環狀RNA;

7) circRNA的(de)鑒定;

8) circRNA的(de)統計;

9) circRNA來(lái)源基因功能注釋;

10) circRNA表達定量分析(定量及統計);

11) 聚類分析;

12) 樣品間circRNA相關性分析(含生物學重複樣品);

13) circRNA差異表達分析;

14) 差異表達circRNA數目統計及聚類分析;

15) 差異表達circRNA來(lái)源基因的(de)功能注釋(NR,GO,KEGG等)及富集分析;

16) 差異表達circRNA來(lái)源基因蛋白互作網絡分析。

結果展示

送樣建議

1) 樣品類型:總RNA;
2) 樣品濃度:≥50ng/µg;
3) RNA總量:≥3µg;
4) RNA純度:OD260/280:1.8-2.0;OD260/230≥1.8,260處有正常峰值;
5) RNA完整度:電泳檢測28s/18s≥1.5或RIN≥7.5(動物)、7(植物、真菌),基線平整(軟體等無28S物種)。


010-80543251

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