産品簡介
環狀RNA(circular RNA)是(shì)5’端和(hé / huò)3’端共價結構閉合環狀的(de)非編碼RNA,是(shì)廣泛存在(zài)于(yú)動植物中的(de)一(yī / yì /yí)種特殊的(de)lncRNA,具有很高的(de)保守性和(hé / huò)組織特異性,獨特的(de)環狀結構使其不(bù)易被RNase降解,在(zài)胞内具有較強的(de)穩定性。按其來(lái)源可分爲(wéi / wèi)内含子(zǐ)CircRNA和(hé / huò)外顯子(zǐ)CircRNA兩類,主要(yào / yāo)通過(1)作用于(yú)轉錄組因子(zǐ),(2)競争性結合miRNA,(3)結合核糖體誘導開環再重新表達等三種方式實現其調控基因表達的(de)功能。CircRNA一(yī / yì /yí)經發現就(jiù)因其獨特的(de)存在(zài)形式引起科學家的(de)廣泛興趣,随着近幾年測序技術的(de)發展,CircRNA檢測技術亦日漸成熟。
研究内容
1) 測序質量值分布統計;
2) 測序堿基質量控制;
3) 測序數據産出(chū)統計;
4) 測序文庫質量評估;
5) 與參考序列進行比對(比對效率統計;比對結果作圖);
6) CIRI識别環狀RNA;
7) circRNA的(de)鑒定;
8) circRNA的(de)統計;
9) circRNA來(lái)源基因功能注釋;
10) circRNA表達定量分析(定量及統計);
11) 聚類分析;
12) 樣品間circRNA相關性分析(含生物學重複樣品);
13) circRNA差異表達分析;
14) 差異表達circRNA數目統計及聚類分析;
15) 差異表達circRNA來(lái)源基因的(de)功能注釋(NR,GO,KEGG等)及富集分析;
16) 差異表達circRNA來(lái)源基因蛋白互作網絡分析。
結果展示
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